Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ETV1P50549 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ETV1P50549 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms