Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EMDP50402 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EMDP50402 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EMDP50402 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms