Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRE11P49959 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRE11P49959 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRE11P49959 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MRE11P49959 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
MRE11P49959 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MRE11P49959 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MRE11P49959 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MRE11P49959 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MRE11P49959 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRE11P49959 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms