Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A3P48764 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms