Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MCAMP43121 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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