Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD12P35452 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms