Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms