Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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