Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PTPRBP23467 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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