Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms