Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms