Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXB9P17482 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms