Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCL3L1P16619 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCL3L1P16619 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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