Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB1P16220 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB1P16220 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms