Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODC1P11926 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ODC1P11926 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms