Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CT47B1P0C2W7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms