Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms