Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTA1P02549 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms