Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA3O96018 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA3O96018 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA3O96018 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA3O96018 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APBA3O96018 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APBA3O96018 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms