Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-214ENST00000559664 5111 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-213ENST00000559523 4454 ntTSL 512.64□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 212.62□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 ACACA-229ENST00000613776 1372 ntTSL 211.43□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-202ENST00000354181 4568 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 122.1
SF3B1O75533 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 321.03■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 122
SF3B1O75533 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.184e-6■■■■■ 121.9
SF3B1O75533 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 121.9
SF3B1O75533 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 14e-6■■■■■ 121.9
SF3B1O75533 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 121.9
SF3B1O75533 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 121.9
SF3B1O75533 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 218.86■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 121.9
SF3B1O75533 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 121.9
SF3B1O75533 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 216.15■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 121.9
SF3B1O75533 AP000487.1-201ENST00000530690 554 ntTSL 418.98■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MPP3-208ENST00000496503 2186 ntTSL 1 (best)16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 RGL2-243ENST00000483151 2772 ntTSL 215.45■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 RGL2-238ENST00000437840 2687 ntTSL 1 (best)15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-204ENST00000415228 2240 ntTSL 513.95□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 AP000487.1-203ENST00000524619 392 ntTSL 313.22□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-208ENST00000462039 2416 ntTSL 212.31□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MPP3-202ENST00000398393 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-203ENST00000370308 2621 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-205ENST00000415954 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-201ENST00000370300 2961 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-219ENST00000524046 467 ntTSL 39.16□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 COG5-209ENST00000484237 574 ntTSL 45.45□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 MTO1-207ENST00000445187 665 ntTSL 35.33□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 214.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 121.8
SF3B1O75533 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.44□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 121.7
SF3B1O75533 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 121.7
SF3B1O75533 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 121.7
SF3B1O75533 RUNX1-208ENST00000455571 610 ntTSL 319.96■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 121.6
SF3B1O75533 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 121.6
SF3B1O75533 PHKB-207ENST00000566037 1032 ntTSL 225.6■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 121.5
SF3B1O75533 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 121.5
SF3B1O75533 PHKB-206ENST00000565424 828 ntTSL 34.68□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 121.5
SF3B1O75533 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 121.5
SF3B1O75533 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.328e-7■■■■■ 121.5
SF3B1O75533 ACLY-209ENST00000590770 583 ntTSL 413.63□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 121.4
SF3B1O75533 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 121.4
SF3B1O75533 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 121.4
SF3B1O75533 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 121.4
SF3B1O75533 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 121.4
SF3B1O75533 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 121.4
SF3B1O75533 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 121.3
SF3B1O75533 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.422e-7■■■■■ 121.3
SF3B1O75533 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 322.93■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 121.3
SF3B1O75533 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 121.3
SF3B1O75533 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 121.3
SF3B1O75533 PHC3-211ENST00000486042 680 ntTSL 32.96□□□□□ -1.931e-8■■■■■ 121.3
SF3B1O75533 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 121.3
SF3B1O75533 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-206ENST00000430636 397 ntTSL 423.45■■□□□ 1.346e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-211ENST00000461492 580 ntTSL 321.15■□□□□ 0.986e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-209ENST00000452060 588 ntTSL 220.65■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-202ENST00000418588 731 ntTSL 320.65■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-203ENST00000419218 562 ntTSL 220.65■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-210ENST00000452317 547 ntTSL 419.66■□□□□ 0.746e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-213ENST00000466701 364 ntTSL 419.44■□□□□ 0.76e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-205ENST00000428779 841 ntTSL 319.36■□□□□ 0.696e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-208ENST00000435508 624 ntTSL 319.36■□□□□ 0.696e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.596e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.496e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-204ENST00000421560 579 ntTSL 417.85■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-212ENST00000461987 372 ntTSL 317.83■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 DAG1-217ENST00000496474 539 ntTSL 417.51■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 121.2
SF3B1O75533 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 121.2
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1536.9 ms