Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F6O75461 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
E2F6O75461 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
E2F6O75461 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms