Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP12O75317 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP12O75317 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP12O75317 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP12O75317 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms