Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPFIA3O75145 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms