Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKNO60260 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKNO60260 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKNO60260 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKNO60260 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKNO60260 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKNO60260 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms