Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTATSF1O43719 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms