Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms