Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNJ2O15056 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNJ2O15056 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms