Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD8O14715 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD8O14715 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms