Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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