Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms