Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf172C9J069 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms