Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRRM5B3KS81 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SRRM5B3KS81 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SRRM5B3KS81 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SRRM5B3KS81 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SRRM5B3KS81 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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