Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms