Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TARSL2A2RTX5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms