Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG4BQ9Y4P1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms