Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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