Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms