Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBE1Q9UJT0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms