Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATPIF1Q9UII2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATPIF1Q9UII2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms