Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCF2Q9UG63 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms