Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms