Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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