Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM8A1Q9UBU6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms