Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPARGC1AQ9UBK2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPARGC1AQ9UBK2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms