Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms