Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHRF1Q9P1Y6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms