Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP4Q9P0V3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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