Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKD2L1Q9P0L9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms