Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VSX1Q9NZR4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX1Q9NZR4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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