Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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